Costa Botes đã trở thành một nhà làm phim độc lập tại New Zealand từ đầu những năm 1980. Bộ phim ngắn Stalin’s Sickle của anh đã giành giải thưởng của ban giám khảo tại Liên hoan phim ngắn Clermont-Ferrand vào năm 1988. Forgotten Silver, một bộ phim tài liệu giả được đồng biên kịch và đồng đạo diễn với Peter Jackson vào năm 1995, đã gây ra một cơn sốt quốc gia vào năm 1995. Nó đã giành được một giải thưởng đặc biệt của các nhà phê bình tại Liên hoan phim Venice và đã trở thành một bộ phim yêu thích của người hâm mộ trên toàn thế giới. Bộ phim đầu tiên của Costa, Saving Grace (1997), đã được chọn để cạnh tranh tại các lễ hội phim Valladolid, Asia-Pacific và Fantasporto. Anh đã ghi lại quá trình làm phim của bộ ba loạt phim Lord of the Rings của Peter Jackson từ năm 1999 đến 2003 với một bộ ba bộ phim tài liệu dài. Những bộ phim này đã được phát hành trong một bộ DVD giới hạn vào năm 2006 và sau đó được bao gồm trong bộ sưu tập blu-ray xác định được phát hành vào năm 2011. Costa đã thành lập công ty sản xuất của mình, Lone Pine Film & TV Productions vào năm 2005 để tạo ra các bộ phim tài liệu độc lập. Những bộ phim này bao gồm Struggle No More (2006), một tiểu sử về ban nhạc không rõ tên của New Zealand, và Yes That’s Me (2008) về một nhạc sĩ blues với bệnh trầm cảm. Anh đã quay, sản xuất và biên tập bộ phim tài liệu Lost In Wonderland vào năm 2009, hướng dẫn cho đạo diễn trẻ Zoe McIntosh. Bộ phim này đã ra mắt tại Liên hoan phim New Zealand và giành nhiều giải thưởng cho quay phim và bộ phim tài liệu xuất sắc nhất vào năm sau tại Giải thưởng phim và truyền hình Qantas New Zealand. Costa đã viết và sản xuất một bộ phim khác cho Zoe, một bộ phim ngắn 35mm có tên Day Trip (2010). Bộ phim này đã được chọn để trình chiếu tại nhiều lễ hội quốc tế, bao gồm Tribeca, Clermont Ferrand và Hawaii. Nó đã giành được giải thưởng Signis tại Espression En Corto tại Mexico và bộ phim ngắn xuất sắc nhất tại Liên hoan phim Montreal First Peoples. Bộ phim tài liệu tiếp theo của Costa, Candyman: The David Klein Story (2010), là về một nhà phát minh bánh kẹo người Mỹ kỳ lạ đã sáng chế ra những viên kẹo Jelly Belly. Nó đã ra mắt tại Slamdance và Hot Docs vào năm 2010 và giành được giải thưởng phim tài liệu xuất sắc nhất do ban giám khảo chọn tại Liên hoan phim Rincon Puerto Rico. Anh đã tiếp theo với hai bộ phim tài liệu dài: Daytime Tiger (2011), một bộ phim về chứng cuồng động; và The Last Dogs of Winter (2012), về một người đàn ông đang chiến đấu để bảo tồn những chú chó kéo xe Inuit hiếm. The Last Dogs of Winter đã có buổi ra mắt thế giới như một lựa chọn chính thức tại Liên hoan phim quốc tế Toronto. Act of Kindness (2015), một bộ phim tài liệu về trải nghiệm của một người New Zealand trẻ ở Rwanda sau vụ thảm sát, đã giành được giải thưởng Biên tập xuất sắc nhất tại Liên hoan phim tài liệu Melbourne. Costa cũng đã viết và sản xuất một bộ phim ngắn khác cho đạo diễn Zoe McIntosh. The World in Your Window (2017) đã được trình chiếu tại nhiều lễ hội quốc tế hàng đầu và đã giành được nhiều giải thưởng tại Clermont-Ferrand, Tokyo, Melbourne, FlickerFest, Vancouver, Prague và Tahiti. Tác phẩm gần đây nhất của anh, Angie (2018), đã ra mắt tại Liên hoan phim quốc tế New Zealand. Một nhà phê bình đã mô tả nó như là một "bộ phim sâu sắc, tối tăm, táo bạo". Một nhà phê bình khác viết, "Costa Botes đã làm phim trong hơn 30 năm: ANGIE là bộ phim xuất sắc nhất của anh. Anh ấy đã có một bàn tay nhẹ nhàng khi nói đến các tài liệu cảm xúc. Anh ấy có khả năng hoà mình vào nền cảnh đẹp và để cho các đối tượng nói, biên tập hoàn hảo của anh ấy đã dệt nên một câu chuyện ma thuật".
